通风不良易出现畸形灵芝，当出现畸芽时要及时割掉。采收灵芝时从柄基部用剪刀切除或用手轻摘，采收后及时阴干，有条件的烘干或晒干至含水量为12%，即为灵芝成品，装袋，置于干燥的室内保存或出售。野生灵芝的药用价值越来越明显，何以称之为药，能治病、能防病、能抗病。野生灵芝并无气味，在药店所买的灵芝之所以有气味一般是由于中药材混杂后导致串味。
建棚地点选择
选择保温保湿，通风良好、光线适量、排水通畅、管理方便的灵芝大棚，棚内要求地面清洁，墙壁光洁，耐潮湿。灵芝棚的大小视培养料的多少而定，一般建在树林、房前屋后林阴处，靠近水源的位置最合适。培养料入棚前菇棚要严格消毒，每立方米空间用甲醛5毫升和高锰酸钾10克密封熏蒸24小时。春种以4~5月最佳，秋种以9~10月最好。
栽配料的制作
栽配料可用棉籽壳77%，麸皮10%，玉米粉10%，糖、磷肥和石膏各1%；或木屑70%，麸皮25%，黄豆粉2%，磷肥1%，石膏1.5%和糖0.5%配制而成。配制时先将棉籽壳、木屑、麸皮、石膏粉等原料拌匀，含水量60%~65%，以用手抓紧时指缝有水溢出但不滴下为好。栽培料拌好后用装袋机装袋，塑料袋选用15厘米乘以35厘米或17厘米33厘米的聚丙烯或聚乙烯筒装，每袋装干料400~450克。聚乙烯袋采用常压灭菌10~12小时，聚丙烯塑料袋采用高压灭菌2小时，待料冷却到30℃以下时入无菌室内接种。1瓶麦粒原种可接种栽培料40~45袋，1瓶棉籽壳栽培种可接种栽培料25~35袋。将已接种的菌袋移入消毒好的培养室内，分层排放，每排放6~8层高，排架之间留有人行通道，每周上下翻动一次，确保菌袋温度均衡，增加袋内氧气，促进发菌，同时去除有绿霉杂菌感染的菌袋。
发菌阶段的管理。灵芝是喜温型真菌，菌丝生长温度以26~28℃为最佳，子实体在24~28℃温度下长势最好，低于18℃子实体不能正常发育。发菌期间，培养室内温度保持22~30℃，空气相对湿度保持50%~60%。每天通风半小时，每隔5~7天菌袋上下翻动1次。当菌丝题发满料袋溶剂三分之二时，移入培养棚内，松开料袋口，用手轻轻一提，留一点缝隙。棚内以散射光为宜，避免强光直射。经25~32天，菌丝便可长满料袋。个别料袋菌丝发育不均匀，可挑出单放。
出芝阶段的管理
当菌丝长满料袋后，用刀片把两端割成5角硬币大小的圆形口，以利出芝。出芝时棚温保持在26~30℃，空气相对湿度提高到90%~95%，并提供散射光和充足氧气，保持地面存有浅水层，每天上午8时前及下午4时后打开门及通风口换气，气温低时中午12时通风换气。原基膨大3~5天，逐渐形成菌盖时，增加喷水保湿，气温过高时喷水保湿。
通风不良易出现畸形灵芝，当出现畸芽时要及时割掉。菌盖逐渐由白色转浅黄色，由黄色转为红褐色，菌盖边缘白色基本消失，边缘变红，菌盖开始革质化，背面弹射出红褐色的雾状孢子时，表明灵芝子实体已成熟，应及时采收。从割口到采收需40~45天。
采收
灵芝采收前1周停止喷水，关闭通风门口，通道地面铺上塑料薄膜，以便收集散发的孢子粉。孢子散发后，菌盖由软变硬，没有浅白色边缘，颜色由淡黄色转变为红褐色，不再生长增厚时，即可采收成熟的灵芝。采收灵芝时从柄基部用剪刀切除或用手轻摘，采收后及时阴干，有条件的烘干或晒干至含水量为12%，即为灵芝成品，装袋，置于干燥的室内保存或出售。成品以身干、菌盖肥厚、菌柄粗壮、质坚硬、色红褐、具漆样光泽者为佳。
注意事项：
春芝的管理：3~6月产出的灵芝叫春芝。这一阶段调湿是关键，要适时进行菌棒浸水。浸水前先用8号铁铲从菌棒的一头穿到另一头，然后把菌棒排放与水槽或水沟中，以淹没菌棒为宜。注意：菌棒减量不到五分之一暂时不浸，温度超过25℃以上暂时不浸。
秋芝的管理：11~12月产出的灵芝叫秋芝。其管理要点：温度保持12~15℃，空气响度湿度保持85%~90%。在空气新鲜的情况下，减少水分蒸发，做好保湿工作。当芝蕾长到黄豆大小时，视天气情况喷水。气温高于20℃时早晚喷，中午不喷；雨雪天不喷；阴天少喷。
冬芝的管理：1~2月产出的灵芝叫冬芝，其质量最好。此时芝房内温度不要低于3℃。早晚不宜开窗，中午气温高时，适当开窗通风换气。
鉴别野生灵芝和人工培育灵芝的主要方法有：
首先，看灵芝的色泽形状。由生长环境的不同以区别，野生灵芝多生长于深山树林中某种已枯死树干上，旁边杂草乱石颇多，故野生灵芝长型多样，色泽各异，而种植灵芝出于种植基地，虽种植户也有刻意模仿野生灵芝生长环境，但大多长型都比较均匀，色泽大致相同。
第二，是比较大小。野生灵芝品种多，形状相对不规则，每类灵芝各有自己的特点，不过，山上采集的灵芝一般都大小不一，不会像人工的那样，大批量的灵芝大小基本上都差不多大。人工栽培的灵芝一般的生长环境都是在温室大棚，这样生长环境生长出来的灵芝往往比野生灵芝的个头大很多，同时灵芝的大小整齐度一致，形状也规则。
第三，是看虫眼。野生灵芝都生长于野外，肯定会遇到虫害的侵袭，所以子实体下方都会留下不规则的虫眼，这个也是必然的，如果没有虫眼，那只能说明这灵芝是人工培育的。人工栽培的灵芝一般都采用农药控制虫害问题，几乎不会有虫眼的。
第四，是闻气味、品味道。野生灵芝的药用价值越来越明显，何以称之为药，能治病、能防病、能抗病。野生灵芝味是苦的，而且很苦，一般来说越是苦的其药效才会显著，古语有云“良药苦口，苦口良药”。野生灵芝并无气味，在药店所买的灵芝之所以有气味一般是由于中药材混杂后导致串味。
第五，是看草梗。野生灵芝常有野外自然的元素。野生灵芝生长环境都是杂草丛生的，难免会有草梗与灵芝缠绕在一起（就长在灵芝体内穿透其间）。
第六，灵芝脚的泥。野生灵芝采摘时肯定会带有泥土，并且泥土很结实，很难掰开。而野生灵芝肯定不是都采集于一个地方，所以它带有的泥土肯定不会是一个地方的泥土。
